Em comunhão com a Igreja, a Pastoral da AIDS tem como missão evangelizar homens e mulheres. Atenta às necessidades das pessoas que vivem com HIV, trabalhar na prevenção e contribuir com a sociedade na contenção da epidemia, envolvendo todos os cristãos na luta contra a AIDS.

Além de prestar assistência aos soropositivos, a Pastoral da AIDS forma lideranças para que se tornem multiplicadores de informação preventiva, capazes de orientar as pessoas para a assistência e tenham nova consciência e atuação no campo dos direitos humanos, das políticas públicas e controle social.